Ne glede na to, ali so nameščeni v prenosnem ali namiznem računalniku, vsi trdi diski uporabljajo podobno tehnologijo: predenje magnetnih plošč, ki zapisujejo in shranjujejo podatke. V prejšnjih generacijah računalnikov je bilo več vrst povezovalnih vmesnikov, ki so se lahko razlikovali med namiznimi in prenosnimi računalniki, vendar standard Serial ATA (SATA) zdaj prevladuje na obeh trgih. Glavne razlike med obema vrstama pogonov so fizična velikost, prostor za shranjevanje in hitrost.
Fizična velikost
V preteklosti so namizni računalniki uporabljali 5,25-palčne trde diske, današnja namizja pa se v prvi vrsti zanašajo na 3,5-palčne pogone. Ta velikost omogoča več notranjih plošč, kar poveča prostor za shranjevanje pogona. Ti pogoni pa so pretežki in debeli za uporabo v prenosnih računalnikih. Namesto tega večina prenosnikov uporablja 2,5-palčne pogone. Ti trdi diski so lažji, tanjši in porabijo manj energije - izjemno ugodno pri uporabi baterij. 1,8-palčni pogoni, ki so pogosto nameščeni v napravah, kot so iPod, se uporabljajo tudi v nekaterih ultratankih prenosnikih in prenosnikih.
Skladiščni prostor
Fizična tankost 2,5-palčnih prenosnih pogonov neposredno vpliva na njihovo zmogljivost shranjevanja. Z manj prostora v notranjosti 2,5-palčni pogoni vsebujejo manj manjših plošč. Medtem ko se nekateri vrhunski 3,5-palčni pogoni ponašajo s 4 TB prostora za shranjevanje - in še naprej rastejo - prenosni pogoni ne morejo ustreči tej trditvi. Namesto tega so tudi najdražji prenosni pogoni velikosti od 750 GB do 1 TB. Medtem ko se prenosni pogoni iz leta v leto tudi povečujejo, jim njihova fizična velikost preprečuje, da bi kdaj dohiteli prostor, ki ga zagotavljajo namizni pogoni.
Hitrost
Za branje in pisanje podatkov se plošče na trdih diskih hitro vrtijo. Medtem ko nekateri diski za navdušence delujejo s hitrostjo 10.000 vrtljajev na minuto, večina namiznih trdih diskov deluje s hitrostjo 7.200 vrt / min. Da bi zmanjšali raven toplote, porabe energije in hrupa, veliko prenosnih pogonov deluje počasneje, s samo 5400 vrtljaji na minuto. Ta zmanjšana hitrost vrtenja neposredno vpliva na hitrost računalnika, saj se mora pogon dlje vrteti, da doseže posamezne podatke. Nekateri modeli prenosnikov pa vključujejo 7.200 pogonov na minuto, kar negativno vpliva na hitrost.
Polprevodniški pogoni
V zadnjih nekaj letih je veliko prenosnih in namiznih računalnikov začelo uporabljati pogone SSD namesto trdih diskov. Ti SSD-ji uporabljajo podatkovne čipe namesto plošč, odstranjujejo hrup, toploto in vibracije, ki jih povzročajo trdi diski. Čeprav so dražji od trdih diskov, SSD diski delujejo tudi bistveno hitreje kot celo 10.000 vrtljajev na minuto. Zaradi razlike v ceni nekateri namizni računalniki vključujejo tako majhen SSD za pogosto uporabljene podatke kot tudi velik trdi disk za večjo zmogljivost shranjevanja. Ker večina prenosnih računalnikov ne more namestiti dveh pogonov, nekateri modeli ponujajo hibridne pogone, ki imajo poleg majhnega SSD-ja za predpomnjenje velik prostor za shranjevanje.
Kompatibilnost
Medtem ko 3,5-palčni pogoni znotraj večine prenosnikov ne morejo stati, jih lahko vseeno povežete z zunanjim ohišjem, ki ga v računalnik priključite prek kabla USB ali zunanjega SATA (eSATA). Podobno lahko na namizje z ohišjem uporabite 2,5-palčne pogone ali pa jih namestite z namestitvenim nosilcem. Nekateri namizni računalniki vključujejo tudi 2,5-palčne pogone, ker je večina SSD-jev te velikosti.